我國科學(xué)家建成以水稻為研究對象的數(shù)據(jù)庫

　　[導(dǎo)讀] 水稻生物學(xué)數(shù)據(jù)庫眾多、信息量大,但大多是生物學(xué)原始數(shù)據(jù).中國水稻研究所鄂志國、王磊、莊杰云等創(chuàng)建了“國家水稻數(shù)據(jù)中心”(http://www.ricedata.cn/),讓難題迎刃而解。

　　數(shù)據(jù)平臺讓水稻更易“讀懂”

　　科技日報(bào)北京4月12日電 （記者馬愛平）水稻生物學(xué)數(shù)據(jù)庫眾多、信息量大，但大多是生物學(xué)原始數(shù)據(jù)；國內(nèi)傳統(tǒng)種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫鮮有二次開發(fā)功能；國內(nèi)缺少整合多學(xué)科數(shù)據(jù)的集成性數(shù)據(jù)庫……如何從海量數(shù)據(jù)中挖掘有用信息提供給農(nóng)業(yè)科研工作者，一直是個難題。中國水稻研究所鄂志國、王磊、莊杰云等創(chuàng)建了“國家水稻數(shù)據(jù)中心”（http://www.ricedata.cn/），讓難題迎刃而解。

　　經(jīng)過10多年的建設(shè)，該平臺已發(fā)展成為一個以水稻為研究對象，融貫多學(xué)科的綜合性數(shù)據(jù)庫。其所載內(nèi)容已被他人引用超過350次，它以網(wǎng)站形式為用戶提供信息，日訪問IP數(shù)超過500個，在國內(nèi)外農(nóng)學(xué)類信息系統(tǒng)中，訪問量名列前茅。

　　據(jù)悉，研究人員開發(fā)系譜數(shù)，創(chuàng)建中國水稻品種及其系譜數(shù)據(jù)庫，收錄國內(nèi)外水稻品種和育種材料等數(shù)據(jù)近1.5萬份；構(gòu)建優(yōu)異稻種資源數(shù)據(jù)集和大品種指紋數(shù)據(jù)集，收集優(yōu)異稻種資源數(shù)據(jù)共計(jì)5379份。

　　“本數(shù)據(jù)庫是國內(nèi)有關(guān)水稻品種資料最全，且唯一帶有系譜追溯功能的數(shù)據(jù)庫。”中國水稻研究所教授鄂志國說，在系譜追溯分析基礎(chǔ)上，研究人員提出“骨干親本”評價方法，即對同時代育成的種質(zhì)和同樣的衍生世代進(jìn)行量化比較，有助于育種家高效選擇親本。

　　科研人員還創(chuàng)建水稻功能基因數(shù)據(jù)庫，以文獻(xiàn)析出的方式整合了國內(nèi)外報(bào)道的水稻功能基因2545個；開發(fā)出基于瀏覽器的遺傳圖譜生成程序和基因結(jié)構(gòu)圖生成程序，并對水稻產(chǎn)量關(guān)鍵性狀相關(guān)數(shù)量性狀基因座（QTL）進(jìn)行圖譜整合。

　　這一平臺收錄水稻相關(guān)術(shù)語2300多條，開創(chuàng)性地將此系統(tǒng)應(yīng)用于水稻功能基因數(shù)據(jù)庫和參考文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的管理；將不同學(xué)科數(shù)據(jù)進(jìn)行有機(jī)整合，有助于節(jié)省科研人員的跨平臺檢索時間，提高了效率。

　　截至目前，該數(shù)據(jù)庫還為國內(nèi)有需求的科研與教學(xué)單位無償提供“目標(biāo)種質(zhì)衍生后代批量查詢”等專項(xiàng)科技服務(wù)，幫助育種家評判目標(biāo)種質(zhì)在育種中的利用價值，高效選擇親本。